Одно из направлений деятельности фонда «Вольное Дело» — развитие здравоохранения. Фонд строит и оснащает медицинские учреждения, поддерживает врачей и помогает бороться с опасными инфекциями. Особое внимание уделяется борьбе с эпидемиями, когда необходимо действовать быстро и обеспечивать медицинскую помощь большому числу пациентов.

Во время вспышки Эболы в Западной Африке в 2014-2016 годах совместно с Роспотребнадзором был построен научный клинико-диагностический центр для борьбы с опасными инфекциями. Медицинский комплекс стоимостью 10 млн долларов возвели всего за 50 дней, в разгар эпидемии. Он стал одним из самых технологически оснащённых учреждений такого профиля в Западной Африке. Российские специалисты оказали бесплатную медицинскую помощь 4,5 тысячи пациентов и обучили 270 гвинейских медработников.

Во время пандемии коронавируса по инициативе Олега Дерипаска в 7 регионах России были в кратчайшие сроки построены современные медицинские центры. Каждый был рассчитан на 60-120 койко-мест и оснащён медицинским оборудованием и техникой для лабораторной и функциональной диагностики. За время пандемии медцентры спасли более 30 тысяч жизней.

За период пандемии фонд направил более миллиона медицинских масок и других СИЗ в российские регионы и более 350 тысяч СИЗ — в московские больницы. Фонд также передал регионам 12 автомобилей скорой помощи, 14 аппаратов ИВЛ, а также запустил программу дистанционного обучения врачей работе с ИВЛ и лечению респираторных заболеваний.

При поддержке фонда были также построены и оборудованы современные ПЦР-лаборатории: две в Черногории и одна при центральной районной больнице в Усть-Лабинске. Лаборатория проводит бесплатные исследования для жителей Усть-Лабинского района и развивает сотрудничество с ведущими научными центрами страны для генетических исследований, а также изучения инфекционных заболеваний.

За годы работы при поддержке Олега Дерипаска по всей стране были построены и отремонтированы десятки больниц, диагностических центров, фельдшерских пунктов и амбулаторий. В их числе — детская поликлиника в Тулуне (Иркутская область), новое хирургическое отделение Центральной районной больницы и современная медицинская клиника широкого профиля в Усть-Лабинске.